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　　LeDock 是一款靈活實用的小分子對接軟件，為了快速準確地將小分子對接成蛋白質而設計的。在Astex多樣性集上，它實現了大于90%的位姿預測精度，并且對于藥物樣分子，每次運行大約需要3秒鐘。它導致從高通量虛擬篩選運動中發現新的激酶抑制劑和溴代氨酶拮抗劑。它直接使用SybYLMOL2格式作為小分子的輸入。Windows操作系統上的圖形版本極大地簡化了藥物化學家的常見多重復雜的對接過程。

【功能特點】

　　位姿預測的高精度

　　用戶友好的虛擬篩選和點擊細化

　　非?？?/p>

【使用說明】

　　1. 抽取受體。

　　直接運行 LeDock.exe

　　結果可以發現，Lepro可以自動去除雜原子，并加氫，殘基的名字也改為charmm的命名方式。Arg226在晶體結構中構象不確定，Lepro自動保存第一個；

　　2. 對接的盒子

　　Lepro還產生一個dock.in的對接配置文件：

　　輸入文件包含以下信息：

　　//

　　Receptor

　　pro.pdb

　　RMSD

　　1.0

　　Binding pocket

　　xmin xmax

　　ymin ymax

　　zmin zmax

　　Number of binding poses

　　20

　　Ligands list

　　ligands.list

　　//

　　“Receptor”、“Binding pocket”、“Number of binding poses”和“Ligands list”是關鍵詞，不可更改。